More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0853 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  85.53 
 
 
492 aa  557  1e-158  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  86.5 
 
 
492 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  85.53 
 
 
491 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  42.26 
 
 
489 aa  272  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  41.75 
 
 
510 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  35.78 
 
 
542 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
671 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
556 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
628 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
549 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
519 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
577 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  37.38 
 
 
551 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  35.14 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
847 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
1319 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
1335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
572 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
547 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.55 
 
 
831 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.18 
 
 
1255 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
546 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  37.11 
 
 
546 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
546 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.28 
 
 
682 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  31.95 
 
 
558 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
609 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
654 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  40.25 
 
 
591 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
640 aa  188  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  38.11 
 
 
557 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
546 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
791 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  40.59 
 
 
547 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  35.46 
 
 
604 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  41 
 
 
557 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  40.83 
 
 
557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
749 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  41 
 
 
543 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
692 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
797 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  39.26 
 
 
559 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
545 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.93 
 
 
583 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  39.33 
 
 
557 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
991 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
549 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
722 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  33.11 
 
 
610 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  39.17 
 
 
513 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
476 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  32.86 
 
 
770 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.47 
 
 
473 aa  162  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.78 
 
 
612 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
515 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
472 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  37.86 
 
 
474 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  40.79 
 
 
474 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  40.79 
 
 
472 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
622 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
617 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  41.7 
 
 
515 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  41.7 
 
 
523 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  41.7 
 
 
521 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  41.7 
 
 
523 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
618 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  41.7 
 
 
520 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  41.7 
 
 
520 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  41.7 
 
 
520 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  34.98 
 
 
620 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
450 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  43.26 
 
 
444 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  43.26 
 
 
442 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
544 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
482 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  35.83 
 
 
449 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
485 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
482 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
445 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
480 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
482 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
483 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  32.84 
 
 
416 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  34.02 
 
 
428 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
428 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  34.02 
 
 
428 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  36.84 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
417 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  34.43 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  36.84 
 
 
451 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
458 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
463 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
462 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>