More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0729 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  100 
 
 		 390 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  59.74 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  56.23 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  61.94 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  58.96 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  58.96 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  60.29 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  58.4 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  60.89 
 
 		 387 aa  356  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  58.92 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  61.43 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  56.19 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.72 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  50.39 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  57.26 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  55.47 
 
 		 401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  61.41 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.94 
 
 		 401 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  56.38 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  54.3 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  60.92 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  55.11 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.62 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  56.86 
 
 		 514 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.14 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 492 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  55.88 
 
 		 422 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  49.85 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  45.03 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.73 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  54.42 
 
 		 405 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  43.37 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  51.91 
 
 		 433 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.98 
 
 		 454 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  44.34 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  45.58 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  45.58 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  45.58 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  43.34 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 440 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  45.58 
 
 		 521 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  45.58 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  45.58 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  45.58 
 
 		 523 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  43.04 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  43.25 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 463 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  42.57 
 
 		 467 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  45.54 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  42.24 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  42.72 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  41.93 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  39.73 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  41.93 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  44.03 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  42.41 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  42.94 
 
 		 446 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  45.75 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  41.93 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  44.03 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  51.96 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  42.41 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  42.41 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  40.94 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  38.98 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 468 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  42.26 
 
 		 454 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  45.42 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  42.26 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 460 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  43.43 
 
 		 469 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  42.58 
 
 		 456 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  39.8 
 
 		 451 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  53.55 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  42.58 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  43.69 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  39.43 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  40.92 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  41.04 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  40.32 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  44.63 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 572 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>