More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0808 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  100 
 
 
510 aa  1026    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  43 
 
 
519 aa  392  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
671 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
609 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  42.21 
 
 
492 aa  361  2e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  38.25 
 
 
547 aa  359  6e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  40.72 
 
 
549 aa  349  8e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
545 aa  348  9e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
797 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
791 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  41.39 
 
 
491 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  40.33 
 
 
640 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  36.35 
 
 
682 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
749 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
489 aa  333  4e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  39.87 
 
 
628 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
549 aa  329  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.63 
 
 
558 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.55 
 
 
583 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  37 
 
 
556 aa  319  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  36.16 
 
 
542 aa  315  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
551 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  36.27 
 
 
722 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  38.02 
 
 
1319 aa  302  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.93 
 
 
547 aa  298  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  38.29 
 
 
1335 aa  299  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
847 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  38.62 
 
 
577 aa  297  4e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
1255 aa  296  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.26 
 
 
604 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
591 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
991 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.17 
 
 
770 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  35.76 
 
 
692 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.65 
 
 
831 aa  286  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  40.25 
 
 
572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  35.54 
 
 
557 aa  282  9e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  35.6 
 
 
543 aa  280  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
557 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
557 aa  273  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
610 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  39.95 
 
 
513 aa  264  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  41.75 
 
 
311 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
546 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
617 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
546 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.02 
 
 
546 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
557 aa  257  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  46.62 
 
 
612 aa  257  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  34.26 
 
 
546 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.59 
 
 
618 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  33.88 
 
 
620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
622 aa  249  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
552 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.94 
 
 
552 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  33 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  33 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  33 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  33 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
544 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
476 aa  224  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  33.48 
 
 
473 aa  221  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
515 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
463 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.94 
 
 
440 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.87 
 
 
438 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
463 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.47 
 
 
465 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
468 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
449 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  32.97 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  33.01 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.88 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.84 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.7 
 
 
447 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.71 
 
 
408 aa  173  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  31.28 
 
 
488 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.53 
 
 
467 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.43 
 
 
454 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
482 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.59 
 
 
444 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  32.43 
 
 
455 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
451 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  32.7 
 
 
447 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.7 
 
 
447 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
467 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
490 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
440 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  31.28 
 
 
489 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
498 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.7 
 
 
447 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
451 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>