More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0032 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  100 
 
 		 404 aa  803    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  62.06 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  56.65 
 
 		 411 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  50 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  45.85 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 465 aa  338  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  48 
 
 		 638 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  48.57 
 
 		 634 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  48.71 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  47.14 
 
 		 563 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  50.57 
 
 		 472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  46.38 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  46 
 
 		 589 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.15 
 
 		 441 aa  322  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.88 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  44.85 
 
 		 572 aa  319  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  45.41 
 
 		 491 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  48.75 
 
 		 639 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  45.45 
 
 		 569 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  48.15 
 
 		 513 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  48.37 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  49.43 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  46.35 
 
 		 468 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 624 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  45.68 
 
 		 560 aa  315  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  48.66 
 
 		 465 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  48.92 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  43.91 
 
 		 477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 508 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 477 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  46.94 
 
 		 467 aa  313  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  48.46 
 
 		 487 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  42.97 
 
 		 480 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  46.59 
 
 		 677 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  42.28 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  43.51 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  44.74 
 
 		 608 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  44.11 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  44.84 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 488 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  42.74 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  46.53 
 
 		 467 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  48.28 
 
 		 568 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  41.73 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 491 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  41.71 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 742 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  44.78 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  42.56 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  43.77 
 
 		 469 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  42.15 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.73 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  45.28 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  44.78 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  47.11 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  48.59 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  42.97 
 
 		 478 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  46.06 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.17 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  41.93 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.17 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  43.37 
 
 		 452 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 482 aa  299  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  41.11 
 
 		 504 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  42.04 
 
 		 451 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 454 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 454 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 454 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  47.47 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  44.17 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  44.17 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  43.56 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.48 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 449 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  45.19 
 
 		 455 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  44.81 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  44.28 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.67 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>