More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0882 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  100 
 
 
446 aa  918    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  46.93 
 
 
463 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.5 
 
 
472 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  46.25 
 
 
444 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  45.9 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
465 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  45.87 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  45.03 
 
 
491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  45.96 
 
 
477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.99 
 
 
624 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
467 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  45.4 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  44.05 
 
 
481 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  47.58 
 
 
472 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  44.32 
 
 
457 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  47.99 
 
 
520 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  47.99 
 
 
520 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  47.99 
 
 
520 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  47.99 
 
 
521 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  48.3 
 
 
515 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  47.69 
 
 
523 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  47.99 
 
 
523 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  47.27 
 
 
472 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  44.35 
 
 
472 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
464 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  47.26 
 
 
474 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  43.97 
 
 
467 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  45.18 
 
 
463 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  43.01 
 
 
441 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  41.54 
 
 
455 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
454 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.1 
 
 
460 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  44.23 
 
 
455 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  44.89 
 
 
445 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
442 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  41.54 
 
 
455 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  41.78 
 
 
478 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  41.54 
 
 
455 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  45.48 
 
 
491 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  42.9 
 
 
469 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  41.71 
 
 
455 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.13 
 
 
442 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.28 
 
 
455 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
465 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  40.05 
 
 
453 aa  292  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.36 
 
 
459 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  42.74 
 
 
479 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  45.53 
 
 
560 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  41.45 
 
 
455 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.67 
 
 
634 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  39.85 
 
 
473 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
608 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  39.31 
 
 
462 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  44.72 
 
 
471 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  42.62 
 
 
432 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
468 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  44.99 
 
 
416 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.36 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
452 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  44.72 
 
 
471 aa  289  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  45.4 
 
 
485 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  43.08 
 
 
452 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
456 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  41.54 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  45.58 
 
 
470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  41.45 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  40.05 
 
 
430 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.66 
 
 
468 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
454 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  41.28 
 
 
454 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  41.28 
 
 
454 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  43.01 
 
 
638 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  40.75 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  41.11 
 
 
589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  43.35 
 
 
471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  44.87 
 
 
484 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  43.43 
 
 
677 aa  282  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  40.64 
 
 
572 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
449 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  41.26 
 
 
569 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  45 
 
 
480 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  43.7 
 
 
458 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  45.77 
 
 
467 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  44.21 
 
 
482 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  46.73 
 
 
445 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
482 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  40.68 
 
 
428 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  44.82 
 
 
488 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.7 
 
 
485 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  44.21 
 
 
433 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
490 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
489 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
513 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  43.35 
 
 
488 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  42.52 
 
 
483 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
491 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  46.42 
 
 
485 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
484 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>