More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1734 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  100 
 
 		 401 aa  804    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1406  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2200  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 463 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  35.36 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.82 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  34.62 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 482 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.4 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  33.53 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.02 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  31.56 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 482 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.35 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  33.24 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  33.24 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.8 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  33.24 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  32.74 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 464 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  31.91 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  32.24 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.74 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  32.15 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  32.54 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  32.24 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.97 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.95 
 
 		 624 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  32.53 
 
 		 459 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.63 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.53 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  32.43 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.33 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  33.33 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.13 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  30.45 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.12 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.12 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  30.38 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.75 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 478 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  30.53 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 466 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 487 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.04 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  31.04 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.59 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 480 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  35.8 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  35.8 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.93 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>