More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0119 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  99.7 
 
 
447 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  99.7 
 
 
447 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  99.7 
 
 
447 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  100 
 
 
335 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  100 
 
 
335 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  98.11 
 
 
446 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  92.74 
 
 
454 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  91.48 
 
 
455 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  91.48 
 
 
447 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  90.51 
 
 
447 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  89.87 
 
 
450 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  90.51 
 
 
469 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  88.27 
 
 
469 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  89.87 
 
 
450 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  89.87 
 
 
450 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  83.39 
 
 
450 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  82.86 
 
 
451 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  82.86 
 
 
451 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  82.22 
 
 
438 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  80.37 
 
 
440 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  77.71 
 
 
440 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  77.29 
 
 
438 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  70.19 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  65.18 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  65.18 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  54.69 
 
 
417 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  52.94 
 
 
608 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  51.84 
 
 
624 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  50.49 
 
 
451 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  52.55 
 
 
450 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  54.1 
 
 
444 aa  325  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  52.2 
 
 
560 aa  325  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  49.69 
 
 
467 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
462 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  50.8 
 
 
472 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  51.91 
 
 
452 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  49.24 
 
 
441 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  51.59 
 
 
449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  48.32 
 
 
473 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  52.61 
 
 
445 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  49.85 
 
 
468 aa  318  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  48.61 
 
 
479 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  53.14 
 
 
491 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  52.81 
 
 
491 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  48.18 
 
 
442 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  53.93 
 
 
492 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  48.91 
 
 
416 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.84 
 
 
456 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  51.76 
 
 
460 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.51 
 
 
459 aa  311  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  51.19 
 
 
469 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  51.24 
 
 
453 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  54.58 
 
 
449 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  54.21 
 
 
482 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  55.87 
 
 
438 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  47.88 
 
 
463 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  50.16 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  50.83 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  50.97 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.83 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.35 
 
 
455 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.83 
 
 
455 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  49.02 
 
 
455 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  50 
 
 
465 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  49.18 
 
 
452 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  47.54 
 
 
454 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  49.38 
 
 
437 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  52.11 
 
 
634 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  53.48 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  53.57 
 
 
485 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  52.11 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  51.03 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  46.58 
 
 
464 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  51.6 
 
 
508 aa  305  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  51.03 
 
 
455 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  52.31 
 
 
478 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  52.31 
 
 
477 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  49.01 
 
 
572 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  51.16 
 
 
482 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  53.48 
 
 
482 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  54.74 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  50.65 
 
 
492 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  51.41 
 
 
638 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  53.48 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  51.96 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  48.14 
 
 
513 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  50.68 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  48.58 
 
 
454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  52.38 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  48.58 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  48.58 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  52.3 
 
 
563 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  52.65 
 
 
677 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  53.97 
 
 
485 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  54.9 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  52.38 
 
 
480 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  49.69 
 
 
437 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  46.39 
 
 
487 aa  301  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  54.9 
 
 
418 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>