More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2200 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1406  type II secretion system protein E  81.1 
 
 		 418 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2200  type II secretion system protein E  100 
 
 		 413 aa  834    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  32.15 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 482 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.44 
 
 		 482 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.77 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.14 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  30.92 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.84 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  31.14 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 485 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  29.54 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  29.59 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.53 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.73 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  31.08 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.94 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.59 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  28.02 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.86 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  31.62 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 458 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.09 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  32.5 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.04 
 
 		 521 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  31.04 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  31.04 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.04 
 
 		 523 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.04 
 
 		 523 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  31.04 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  28.97 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  28.97 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 455 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  31.38 
 
 		 455 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  31.38 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.67 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  29.89 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  29.36 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.22 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  27.5 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.84 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.67 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.47 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.38 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.06 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.1 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.27 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 		 569 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.22 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>