More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2567 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  100 
 
 
469 aa  932    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  63.04 
 
 
446 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50.25 
 
 
445 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  47.14 
 
 
451 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
442 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  49.74 
 
 
452 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.47 
 
 
464 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  45.89 
 
 
469 aa  360  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  51.4 
 
 
463 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  51.08 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  49.34 
 
 
450 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  55.72 
 
 
444 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  51.19 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  50.93 
 
 
437 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  48.44 
 
 
467 aa  350  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  47.41 
 
 
463 aa  350  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  51.93 
 
 
472 aa  349  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.49 
 
 
449 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  54.42 
 
 
468 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  49.73 
 
 
624 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  45.63 
 
 
462 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.98 
 
 
455 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  50 
 
 
465 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  50 
 
 
442 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  49.15 
 
 
491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  46.55 
 
 
455 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  47.92 
 
 
474 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  46.55 
 
 
455 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  46.55 
 
 
455 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  48.2 
 
 
457 aa  342  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  50.68 
 
 
594 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.32 
 
 
463 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  50.27 
 
 
437 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  48.53 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  52.07 
 
 
465 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  50.39 
 
 
452 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  44.25 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.76 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  43.91 
 
 
482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  52.51 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.2 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  44.7 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  46.49 
 
 
498 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  44.53 
 
 
459 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  44.19 
 
 
467 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  43.77 
 
 
467 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  44.04 
 
 
456 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
478 aa  335  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
477 aa  335  9e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  50.42 
 
 
639 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.72 
 
 
472 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  51.81 
 
 
470 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  43.33 
 
 
490 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  43.94 
 
 
458 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  43.93 
 
 
480 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
484 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  46.37 
 
 
495 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  49.29 
 
 
473 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  49.4 
 
 
487 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.46 
 
 
460 aa  334  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  50.81 
 
 
416 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  46.23 
 
 
468 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  49.04 
 
 
677 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  44.39 
 
 
500 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
482 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.27 
 
 
453 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  42.79 
 
 
482 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  50.29 
 
 
454 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  50.29 
 
 
454 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  50.29 
 
 
454 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  43.28 
 
 
483 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  44.16 
 
 
489 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  42.3 
 
 
482 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  44.15 
 
 
485 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.43 
 
 
455 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  49.46 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  46.72 
 
 
452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  44.85 
 
 
485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
488 aa  329  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  51.01 
 
 
634 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.43 
 
 
455 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  49.14 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.14 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  48.61 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  46.61 
 
 
481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  45.59 
 
 
437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.1 
 
 
508 aa  326  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  43.67 
 
 
488 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  56.59 
 
 
563 aa  326  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  45.8 
 
 
445 aa  326  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.43 
 
 
454 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  44.17 
 
 
477 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  44.67 
 
 
476 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  46.24 
 
 
504 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  43.8 
 
 
449 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  53.73 
 
 
560 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  50.75 
 
 
478 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  53.21 
 
 
638 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>