More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0956 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0956  type II secretion system protein E  100 
 
 		 342 aa  692    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.241792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  66.96 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  59.77 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  56.89 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  24.57 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  23.47 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  24.91 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  25.26 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.02 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  25.59 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  24.58 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  24.43 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  22.75 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  26.29 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  27.8 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  22.3 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  23.92 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  22.01 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  27.39 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  22.3 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  22.78 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  24.91 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  21.78 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  25.82 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  25.4 
 
 		 453 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  30.81 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  31.43 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  24.91 
 
 		 572 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0005  conjugative transfer regulon protein  30.43 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  24.24 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  24 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  29.86 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  23.84 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  27.08 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  24.86 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  30.56 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0043  twitching motility protein  32.48 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  23.66 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 463 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  25.45 
 
 		 569 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  22.39 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  25.54 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  30.53 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  24.4 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  25.76 
 
 		 474 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  31.3 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  29.86 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1734  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  24.87 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  24.51 
 
 		 638 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0580  twitching motility protein  34.17 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  22.92 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  28.08 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  23.88 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  25.23 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  23.79 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  26.11 
 
 		 591 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  30.77 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  28 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  29.17 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  25.15 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  33.04 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  23.47 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  24.21 
 
 		 521 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  26.47 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  33.04 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  29.17 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  30.14 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  23.47 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  28 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  28 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  28 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  23.47 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  30.56 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  24.7 
 
 		 556 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  33.04 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  29.29 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  25.44 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  26.16 
 
 		 545 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  29.29 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  28.24 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  29.86 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  29.41 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  24.32 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  24.29 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  24.51 
 
 		 634 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  28 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  29.58 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  27.61 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  29.17 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 806 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>