More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5029 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  100 
 
 		 428 aa  879    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  85.43 
 
 		 434 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  85.43 
 
 		 445 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  78.22 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  75.93 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  68.75 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  61.89 
 
 		 397 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4672  twitching motility protein  63.66 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  57.47 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  55.04 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1724  pilus retraction protein PilT  59.72 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  46.69 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  45.65 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  46.13 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  46.13 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  46.13 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  44.74 
 
 		 344 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  46.08 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  44.74 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  45.24 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  45.24 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  45.24 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  44.74 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  45.24 
 
 		 344 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  45.54 
 
 		 345 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  44.94 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  44.64 
 
 		 345 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  43.15 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  44.02 
 
 		 347 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  44.94 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  44.02 
 
 		 347 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  44.94 
 
 		 345 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  45.15 
 
 		 346 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.73 
 
 		 347 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  44.31 
 
 		 347 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  44.09 
 
 		 347 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  44.68 
 
 		 347 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  44.35 
 
 		 345 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  45.18 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  44.15 
 
 		 344 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  44.15 
 
 		 344 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  43.73 
 
 		 347 aa  296  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  43.84 
 
 		 349 aa  296  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  43.57 
 
 		 344 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  44.55 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  43.53 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  44.02 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  44.58 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.54 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.84 
 
 		 347 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  45.32 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  43.53 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  43.15 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  43.75 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.65 
 
 		 347 aa  292  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  43.53 
 
 		 347 aa  292  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.41 
 
 		 344 aa  292  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.41 
 
 		 344 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  42.98 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  45.54 
 
 		 349 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  43.27 
 
 		 344 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  45.54 
 
 		 349 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.18 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  43.27 
 
 		 344 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  42.65 
 
 		 347 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  44.88 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  42.73 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  43.15 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.94 
 
 		 347 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  42.47 
 
 		 345 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  42.98 
 
 		 344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  44.31 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  43.45 
 
 		 356 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  44.21 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  42.35 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  42.11 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  43.67 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  42.86 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  43.79 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  43.75 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  43.45 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  44 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  43.79 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  42.2 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  43.45 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  41.57 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  41.4 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  43.15 
 
 		 345 aa  280  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  45.24 
 
 		 360 aa  279  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  41.41 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  42.86 
 
 		 357 aa  279  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  43.45 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  42.49 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  43.87 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  42.86 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  42.86 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  42.41 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  42.22 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  43.44 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>