More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1724 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1724  pilus retraction protein PilT  100 
 
 		 372 aa  757    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  77.29 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  70.9 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  59.8 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  56.17 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  62.28 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  62.28 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  60 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  60.79 
 
 		 414 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  58.93 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4672  twitching motility protein  57.44 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  51.79 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  51.79 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  52.24 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  52.71 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.12 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  53.33 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  53.33 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  52.09 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  52.09 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  52.09 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  51.55 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  53.33 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  53.33 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.94 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  51.55 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  52.85 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  51.16 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  50.95 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  52.55 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  51.49 
 
 		 345 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.55 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  52.31 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  52.09 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.15 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  51.49 
 
 		 345 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  50.39 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  48.92 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  52.94 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  51.16 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  45.22 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  44.9 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  50.18 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  47.77 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  50.39 
 
 		 347 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  49.08 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  51.92 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  51.16 
 
 		 347 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  51.16 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  48.71 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  50.36 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  51.16 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  50.95 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  51.16 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  48.2 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.98 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  51.12 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  51.55 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  51.55 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.61 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  48.56 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  50.39 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  48.52 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.56 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  49.02 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  49.81 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  51.55 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  52.09 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  51.49 
 
 		 345 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.81 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  41.78 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  48.29 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  51.16 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.81 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  48.29 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50.18 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  49.1 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  50.2 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  49.46 
 
 		 350 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  50.59 
 
 		 344 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.81 
 
 		 344 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  50.59 
 
 		 344 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  46.08 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  46.69 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  49.82 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  52.06 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  51.16 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  48.47 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.08 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  51.37 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  50.58 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  50.77 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  50.59 
 
 		 349 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  47.41 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  49.28 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  43.14 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  50.2 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>