More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0278 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  100 
 
 		 352 aa  722    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  66.95 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  61.36 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  61.65 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  51.83 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  48.63 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  46.86 
 
 		 349 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  50 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.88 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.74 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  49.29 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  47.88 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  49.29 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.48 
 
 		 339 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  49.29 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.61 
 
 		 372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  49.01 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  49.01 
 
 		 366 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  47.59 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.46 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  47.59 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  47.62 
 
 		 375 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  48.21 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  46.89 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  47.31 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  47.01 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.16 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  48.15 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  46.41 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.32 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.31 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  45.33 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  45.17 
 
 		 365 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  50.93 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  48.7 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  53.4 
 
 		 351 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  46.93 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  43.39 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  43.68 
 
 		 363 aa  305  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  46.65 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.6 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  46.69 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  51.46 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  52.19 
 
 		 347 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  44.6 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.01 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  46.26 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.1 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.01 
 
 		 382 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  45.7 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  47.16 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  50.15 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  46.73 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  42.98 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  48.2 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.24 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  46.73 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  48.16 
 
 		 566 aa  295  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  47.81 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  44.08 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.89 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  46.41 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  45.67 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  45.13 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  45.66 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  41.6 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.81 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  49.33 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.88 
 
 		 383 aa  291  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.51 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  44.91 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  45.87 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.59 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  42.9 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  45.33 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  41.88 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  46.11 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  47.35 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.06 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.39 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  42.78 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  50 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.06 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  45.77 
 
 		 350 aa  289  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  45.13 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  43.47 
 
 		 351 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  44.74 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.6 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  45.75 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  45.75 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  47.98 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  45.19 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  44.67 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  45.23 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  43.5 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.89 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  47.09 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  41.71 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  46.76 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>