More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0671 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  100 
 
 		 471 aa  931    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  41.97 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  41.28 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 504 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 692 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 559 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  37.44 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 481 aa  203  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 499 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 459 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.2 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  31.44 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.67 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  33.59 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.59 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.59 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.96 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.1 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  32.92 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  32.9 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.81 
 
 		 572 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.54 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  36.83 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  30.75 
 
 		 569 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 455 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.53 
 
 		 462 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.84 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.17 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.74 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  33.92 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  29.68 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.44 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 639 aa  153  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.49 
 
 		 624 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.58 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  33.17 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.59 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.06 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.94 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.4 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  33.15 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  35.03 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.82 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  35.03 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  36.58 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  35.03 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.18 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  30.46 
 
 		 638 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.23 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>