More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1541 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  100 
 
 
437 aa  877    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  54.07 
 
 
499 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  53.88 
 
 
433 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  54.57 
 
 
433 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  51.28 
 
 
448 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  52.08 
 
 
442 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  47.48 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  48.45 
 
 
442 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
483 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  49.23 
 
 
431 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
452 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  43.94 
 
 
456 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
481 aa  266  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  47.42 
 
 
452 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
471 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.81 
 
 
463 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  39.76 
 
 
465 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  39.46 
 
 
463 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.13 
 
 
479 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
444 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.08 
 
 
450 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.73 
 
 
472 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  35 
 
 
449 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  39.7 
 
 
411 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.2 
 
 
453 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.97 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.23 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.23 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
450 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
450 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
450 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  36.03 
 
 
508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
454 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.69 
 
 
473 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  36.17 
 
 
523 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.12 
 
 
447 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  39.12 
 
 
438 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.27 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
677 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  36.08 
 
 
467 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  38.64 
 
 
469 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
469 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
454 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  38.24 
 
 
446 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  37.25 
 
 
438 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.8 
 
 
468 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  38.24 
 
 
447 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.2 
 
 
464 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  38.24 
 
 
447 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  38.24 
 
 
447 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.09 
 
 
455 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  36.72 
 
 
456 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  35.91 
 
 
589 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.94 
 
 
412 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.26 
 
 
487 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
454 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  39.42 
 
 
468 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
454 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
454 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.88 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  36.68 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  37.18 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  36.41 
 
 
455 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  37.42 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  36.41 
 
 
455 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  34.69 
 
 
466 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.09 
 
 
441 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  37.31 
 
 
639 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
455 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
455 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  36.45 
 
 
452 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  36.54 
 
 
572 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  37.58 
 
 
491 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
466 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
467 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.33 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  35.77 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  35.4 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  41.59 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.61 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  37.38 
 
 
446 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
437 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
440 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  36.54 
 
 
569 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  33.79 
 
 
428 aa  183  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  31.46 
 
 
433 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
469 aa  183  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
482 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
440 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  31.06 
 
 
491 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>