More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0364 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  100 
 
 
387 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  63.9 
 
 
437 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  61.78 
 
 
415 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  65.18 
 
 
400 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  60 
 
 
398 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  61.33 
 
 
383 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  59.12 
 
 
388 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  59.12 
 
 
388 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  59.12 
 
 
388 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  58.2 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  60.87 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  56.78 
 
 
387 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  58.29 
 
 
389 aa  342  9e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  61.58 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  58.68 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  51.45 
 
 
389 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  58.84 
 
 
398 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  60.25 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  60.69 
 
 
514 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  61.89 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50.4 
 
 
432 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  54.4 
 
 
492 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  53.19 
 
 
433 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.94 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  57.29 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  60.58 
 
 
379 aa  305  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  59.38 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  57.26 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.72 
 
 
378 aa  302  6.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  55.96 
 
 
405 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  53.31 
 
 
393 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.42 
 
 
396 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  46.46 
 
 
386 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48.49 
 
 
444 aa  276  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  46.67 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  46.33 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  46.64 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  46.64 
 
 
472 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  46 
 
 
465 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  45.33 
 
 
463 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
463 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  45.54 
 
 
440 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  46.98 
 
 
474 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  46.9 
 
 
458 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  43.27 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  41.75 
 
 
479 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  43.98 
 
 
454 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
452 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  43.03 
 
 
453 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  43.7 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  46.6 
 
 
455 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.32 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  47.32 
 
 
515 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  47.62 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  47.62 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  47.62 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  47.62 
 
 
521 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  47.62 
 
 
523 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  47.62 
 
 
523 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  45.34 
 
 
438 aa  262  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  45.17 
 
 
447 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.73 
 
 
464 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  44.65 
 
 
449 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  45.65 
 
 
624 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  44.06 
 
 
457 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  45.58 
 
 
466 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.88 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  45.39 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  44.86 
 
 
450 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  44.86 
 
 
450 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  44.86 
 
 
450 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  43.53 
 
 
455 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
491 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  43.53 
 
 
455 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.44 
 
 
455 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  45.57 
 
 
445 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  44.9 
 
 
483 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
456 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  50.68 
 
 
468 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  45.27 
 
 
468 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  42.24 
 
 
572 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  48.3 
 
 
491 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  46.41 
 
 
450 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  45.92 
 
 
459 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
412 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  42.94 
 
 
455 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
485 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
455 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
482 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.76 
 
 
455 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  50 
 
 
471 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
478 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  43.1 
 
 
455 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  41.37 
 
 
569 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
482 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  42.86 
 
 
589 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  43.88 
 
 
482 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  46.82 
 
 
450 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  47.62 
 
 
452 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  40.99 
 
 
477 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>