More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3134 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  100 
 
 		 448 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  72.98 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  71.3 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  70.82 
 
 		 433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  51.28 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  45.71 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  45.67 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  45.54 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  45.09 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  46.41 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  43.13 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  37.28 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.22 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  39.51 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  37.44 
 
 		 466 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  36.65 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.96 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  40.56 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.46 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  38.62 
 
 		 572 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  36.46 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  36.48 
 
 		 692 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  39.54 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 469 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.24 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 462 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  39.05 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.57 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 478 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.31 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.72 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  35.05 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  38.55 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  38.37 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.37 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  38.7 
 
 		 589 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 639 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  38.37 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 487 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  36.46 
 
 		 450 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  38.11 
 
 		 491 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  36.87 
 
 		 438 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  38.77 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  38.46 
 
 		 523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  38.46 
 
 		 523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  38.46 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  38.46 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  38.46 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  38.46 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 482 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 468 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 472 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  40.53 
 
 		 387 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  35.7 
 
 		 440 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  37.8 
 
 		 677 aa  199  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  35.91 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  38.38 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  35.64 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.08 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.24 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  35.64 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  35.64 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  35.96 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  35.79 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>