More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8746 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  100 
 
 		 692 aa  1385    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 523 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  34.47 
 
 		 433 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  35.21 
 
 		 433 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 508 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 504 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  40.23 
 
 		 448 aa  210  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  33.41 
 
 		 466 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 442 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 452 aa  180  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 437 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 452 aa  170  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  32.37 
 
 		 452 aa  157  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  31.51 
 
 		 456 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 483 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  28.53 
 
 		 638 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 449 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 479 aa  125  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  29.47 
 
 		 634 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 444 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 440 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.35 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.54 
 
 		 453 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  26.34 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.88 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 		 572 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.06 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 411 aa  120  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 639 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  28.87 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  34.07 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  32.06 
 
 		 450 aa  119  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  34.07 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  34.07 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  32.43 
 
 		 414 aa  118  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 435 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  29.72 
 
 		 474 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.07 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  35.11 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  32.71 
 
 		 441 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  25.92 
 
 		 465 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.8 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.86 
 
 		 447 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 447 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  27.05 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  33.52 
 
 		 408 aa  116  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  34.99 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 450 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 450 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 450 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 478 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 472 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.28 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 492 aa  114  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  27.37 
 
 		 569 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 500 aa  114  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 414 aa  113  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1709  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 612 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.35 
 
 		 454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 407 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.18 
 
 		 449 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  27.17 
 
 		 487 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 472 aa  111  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  33.58 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.19 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 412 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  26.82 
 
 		 485 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.83 
 
 		 452 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.72 
 
 		 477 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 468 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  35.22 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  35.22 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  26.8 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3782  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  26.4 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  28.61 
 
 		 438 aa  108  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 482 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>