More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1252 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  100 
 
 
435 aa  858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  63.54 
 
 
438 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  63.18 
 
 
414 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  62.37 
 
 
435 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  58.73 
 
 
419 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  57.11 
 
 
414 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  60.31 
 
 
418 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  56.96 
 
 
407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  56.6 
 
 
408 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  56.96 
 
 
407 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  55.22 
 
 
411 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  61.48 
 
 
430 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  56.28 
 
 
408 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  56.39 
 
 
412 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
444 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  37.53 
 
 
463 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  40.69 
 
 
465 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.52 
 
 
452 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
450 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  37.41 
 
 
445 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
487 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.03 
 
 
442 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  36.58 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  36.15 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  37.71 
 
 
521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.18 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.4 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.89 
 
 
472 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  36.13 
 
 
451 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  40.68 
 
 
465 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
498 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.1 
 
 
453 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
437 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
459 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  36.25 
 
 
463 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
508 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.15 
 
 
624 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  35.57 
 
 
456 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.72 
 
 
572 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.19 
 
 
472 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
474 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  39.48 
 
 
458 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.37 
 
 
482 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
491 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.25 
 
 
455 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  35.65 
 
 
454 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.81 
 
 
468 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
454 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
454 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
467 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
454 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
483 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  42.26 
 
 
471 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
469 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
485 aa  226  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
482 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
491 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  32.74 
 
 
478 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.08 
 
 
479 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
482 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
438 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33.99 
 
 
634 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
639 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.25 
 
 
477 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
488 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.85 
 
 
594 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.07 
 
 
462 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
460 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
495 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.83 
 
 
638 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  35.19 
 
 
480 aa  223  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
498 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
470 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  41.09 
 
 
408 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  36.25 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  38.12 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  42.36 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  37.35 
 
 
482 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  37.39 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  35.35 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.49 
 
 
569 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  37.97 
 
 
455 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  38.81 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  39.32 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  37.97 
 
 
455 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  37.97 
 
 
455 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  35.29 
 
 
428 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  37.97 
 
 
455 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  37.11 
 
 
677 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  36.05 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  38.73 
 
 
478 aa  219  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
491 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  36.05 
 
 
428 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>