More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1739 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  100 
 
 		 414 aa  828    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  70.27 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  70.34 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  67.16 
 
 		 419 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  62.1 
 
 		 407 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  62.35 
 
 		 407 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  61.39 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  63.18 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  63.13 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  59.66 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  63.9 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.73 
 
 		 408 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  56.07 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  63.14 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.81 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 491 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  40.55 
 
 		 450 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.27 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  38.06 
 
 		 479 aa  235  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  37.98 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  39.32 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 454 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  41.69 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  37.91 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  37.3 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  40.89 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  37.64 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 482 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 482 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  38.91 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  37.47 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  37.47 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  37.06 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  37.47 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 485 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.97 
 
 		 441 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.64 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  36.29 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 		 572 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  40.53 
 
 		 498 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 454 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.45 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  35.91 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  34.96 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  38.01 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  36.74 
 
 		 476 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  38.38 
 
 		 465 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 480 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 458 aa  222  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 445 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  37.65 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 488 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  37.65 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.67 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  36.87 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  36.26 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  34.45 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  37.28 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 474 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  37.76 
 
 		 515 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  36.26 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  37.54 
 
 		 634 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  39.08 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  38.7 
 
 		 624 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 481 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  38.75 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.64 
 
 		 638 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  33.68 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  37.91 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  39.56 
 
 		 491 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  37.46 
 
 		 523 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  37.46 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  38.63 
 
 		 472 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>