More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2791 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  100 
 
 
414 aa  809    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  67.26 
 
 
418 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  64.88 
 
 
419 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  61.07 
 
 
411 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  61.65 
 
 
438 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  63.08 
 
 
407 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  62.8 
 
 
435 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  62.5 
 
 
407 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  61.39 
 
 
414 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  66.02 
 
 
412 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  59.51 
 
 
408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  59.31 
 
 
408 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  64.52 
 
 
430 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  57.11 
 
 
435 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.98 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.62 
 
 
452 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  41.46 
 
 
450 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  42.12 
 
 
458 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  40.82 
 
 
449 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  42.28 
 
 
460 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
487 aa  236  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.15 
 
 
462 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
463 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
454 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  41.74 
 
 
454 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
474 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.54 
 
 
472 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
465 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
449 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
445 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  40.37 
 
 
456 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
469 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  42.22 
 
 
453 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  38.18 
 
 
479 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  38.17 
 
 
572 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
634 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  39.17 
 
 
477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.96 
 
 
441 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  37.05 
 
 
451 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
513 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
465 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  43.25 
 
 
491 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.53 
 
 
459 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  39.17 
 
 
478 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  40.53 
 
 
408 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
455 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
455 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  39.08 
 
 
638 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
470 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  38.4 
 
 
491 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.59 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  38.59 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  40.81 
 
 
455 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  37.31 
 
 
569 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  39.94 
 
 
455 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  38.68 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  37.97 
 
 
589 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
465 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  39.56 
 
 
563 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.94 
 
 
455 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
463 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  38.63 
 
 
442 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  40.96 
 
 
438 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  41.42 
 
 
438 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  38.62 
 
 
432 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
463 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  38.73 
 
 
624 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  38.05 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  41.72 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  37.08 
 
 
594 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  42.64 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  38.55 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.71 
 
 
473 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
472 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
472 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  37.69 
 
 
472 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  40.58 
 
 
437 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.1 
 
 
485 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  36.62 
 
 
449 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
484 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  40.97 
 
 
469 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  39.49 
 
 
452 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  40.51 
 
 
440 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
639 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
457 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
485 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  40.51 
 
 
446 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
440 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  34.26 
 
 
521 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  39.76 
 
 
568 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  40.06 
 
 
450 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  39.17 
 
 
457 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
437 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>