More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3789 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  100 
 
 		 412 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  66.26 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  66.02 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  66.01 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  64.78 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  63.9 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  63.79 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  64.27 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.2 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  64.27 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  68.64 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.93 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  57.39 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  56.25 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  41.93 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.71 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 454 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  41.61 
 
 		 491 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  40.25 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  40.51 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  38.83 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.42 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  38.4 
 
 		 634 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  38.93 
 
 		 563 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  38.02 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 471 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 491 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 463 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  40.52 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  38.63 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  38.06 
 
 		 638 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 454 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 454 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 454 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 460 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.05 
 
 		 455 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  36.89 
 
 		 572 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.57 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  40 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  35.19 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 442 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  42.51 
 
 		 498 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  36.44 
 
 		 569 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  39.45 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 495 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  39.03 
 
 		 568 aa  225  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  44.37 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  38.18 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  39.23 
 
 		 624 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  37.38 
 
 		 589 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  35.95 
 
 		 442 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 485 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  39.36 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.83 
 
 		 472 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 508 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.75 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  39.03 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 677 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  34.91 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  34.91 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  34.91 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  40.36 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  37.18 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  37.18 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 478 aa  215  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  36.49 
 
 		 594 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>