More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2408 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  100 
 
 		 407 aa  814    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  90.42 
 
 		 407 aa  746    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  67.89 
 
 		 408 aa  541  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  63.3 
 
 		 438 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  62.35 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  63.08 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  63.05 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  62.16 
 
 		 408 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  61.69 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  63.08 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  63.79 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  56.9 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  64.76 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  56.96 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  47.06 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  40.74 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.72 
 
 		 472 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 463 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  41.94 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  42.2 
 
 		 491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  38.65 
 
 		 453 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.59 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  39 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  38.31 
 
 		 638 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 462 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  39.94 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  44.66 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  39.94 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  39.94 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.71 
 
 		 455 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.94 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 460 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  40.88 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 487 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  39 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  39 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  37.78 
 
 		 634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  44.26 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  42.36 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.07 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  38.75 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.87 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  43.3 
 
 		 468 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 465 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  43.21 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  40.52 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  42.62 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  44.56 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  41.27 
 
 		 442 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.5 
 
 		 624 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  38.71 
 
 		 563 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  39.87 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  37.23 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 469 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.69 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  40.45 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  42.57 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  42.48 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  39.8 
 
 		 467 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  45.27 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  38.85 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  41.7 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  40.99 
 
 		 608 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 639 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  38.29 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  37.97 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  37.58 
 
 		 473 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 478 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 521 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 485 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 469 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 677 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  35.69 
 
 		 569 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>