More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1672 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  100 
 
 		 419 aa  826    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  69.73 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  70.94 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  67.16 
 
 		 414 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  64.88 
 
 		 414 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  63.07 
 
 		 407 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  64.45 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  61.69 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  61.92 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  64.27 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  58.73 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  57.57 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.25 
 
 		 408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  66.67 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  45.98 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  44.61 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  41.1 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  36.98 
 
 		 638 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  40.52 
 
 		 563 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  43.29 
 
 		 465 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  41.21 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  40.55 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.36 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 487 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 495 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  42.54 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  41.24 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.14 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  37.09 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  39.74 
 
 		 491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  40.17 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  40.13 
 
 		 634 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  37.38 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  41.21 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.94 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  41.08 
 
 		 477 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.27 
 
 		 624 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  40 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  38.25 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 455 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  42.25 
 
 		 468 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  40.76 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  37.7 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.7 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  40.95 
 
 		 568 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  39.75 
 
 		 458 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 513 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  38.42 
 
 		 594 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  40 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.68 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 639 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  38.11 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  37.92 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  40.49 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  39.08 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  40.49 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  41.95 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  41.27 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  38.77 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  37.92 
 
 		 490 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  40.45 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 483 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  41.61 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  40.53 
 
 		 608 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  38.15 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 488 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>