More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5826 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  100 
 
 		 438 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  82.53 
 
 		 435 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  69.73 
 
 		 419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  70.27 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  63.86 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  63.54 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  63.3 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  61.65 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  62.99 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  66.26 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  64.45 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  60.05 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  62.79 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.59 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.24 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.54 
 
 		 468 aa  256  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  38.11 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.86 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  38.12 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  41.27 
 
 		 442 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  40.27 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  37.93 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 455 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.74 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.87 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  38.87 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  38.87 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  38.87 
 
 		 455 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.21 
 
 		 572 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  37.43 
 
 		 638 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  42.99 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  37.6 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  42.48 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  39.2 
 
 		 634 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 624 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  37.44 
 
 		 491 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  42.48 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  38 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  37.18 
 
 		 521 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  37.47 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.07 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  38.01 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  39.63 
 
 		 450 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  40.17 
 
 		 485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  37.01 
 
 		 563 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  39.43 
 
 		 589 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  41.69 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  43.91 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  36.93 
 
 		 452 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.54 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.85 
 
 		 478 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.63 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 465 aa  231  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 521 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  38.71 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  41.14 
 
 		 568 aa  229  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  36 
 
 		 467 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 608 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 639 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36.48 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  37.95 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  37.92 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  38.25 
 
 		 483 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.96 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  38.22 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  38.22 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  37.96 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  37.5 
 
 		 560 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 677 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  38.63 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.25 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.79 
 
 		 490 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  39.63 
 
 		 476 aa  226  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>