More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0779 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  82.53 
 
 		 438 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  100 
 
 		 435 aa  867    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  70.34 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  70.94 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2791  type II secretion system protein E  62.8 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  hitchhiker  0.00120001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  63.46 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  63.05 
 
 		 407 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  61.82 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3789  type II secretion system protein E  66.01 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00317882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  65.64 
 
 		 418 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  60.15 
 
 		 411 aa  491  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  62.37 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  60.34 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10320  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  64.43 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00794081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 454 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  38.89 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 455 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  39.48 
 
 		 491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 460 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.96 
 
 		 572 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  38.55 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.34 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  37.92 
 
 		 563 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  37.15 
 
 		 455 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 455 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.01 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  36.9 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  36.9 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  39.46 
 
 		 634 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 485 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 624 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.21 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  37.78 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  34.77 
 
 		 569 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  43.31 
 
 		 465 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.25 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.8 
 
 		 521 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  38.7 
 
 		 638 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.78 
 
 		 639 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 484 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 498 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.12 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 495 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 608 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 485 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.67 
 
 		 451 aa  226  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  36.43 
 
 		 432 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 513 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  39.58 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.54 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 477 aa  222  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.75 
 
 		 474 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  33.18 
 
 		 467 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  35.63 
 
 		 589 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  38.63 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  37.92 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 491 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  33.83 
 
 		 594 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>