More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8599 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  100 
 
 		 431 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  51.16 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  54.57 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  60.18 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  61.11 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  52.81 
 
 		 433 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  56 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  51.13 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  50.86 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  50.29 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  49.23 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 499 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  42.51 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  40.34 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.76 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  38.57 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 449 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  36.39 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.58 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 466 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  36.69 
 
 		 569 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.17 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  36.26 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 472 aa  206  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 463 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  34.88 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  37.91 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  37.84 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  39.32 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  35.81 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  38.25 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  37.65 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  38.25 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.97 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  37.01 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.12 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  37.65 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 455 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 473 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 487 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 508 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  37.06 
 
 		 521 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  39.84 
 
 		 692 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  37.06 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  37.06 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  37.06 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  37.06 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  36.76 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 521 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.47 
 
 		 454 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  36.12 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  36.76 
 
 		 523 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  37.06 
 
 		 447 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  37.06 
 
 		 447 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  37.06 
 
 		 447 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.98 
 
 		 498 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 466 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>