More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1223 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  100 
 
 		 452 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  52.42 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  53.14 
 
 		 481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  56 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  46.56 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  46.3 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  44.01 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  40.92 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  36.88 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 479 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 465 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.69 
 
 		 572 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 450 aa  222  9e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  37.26 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.93 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 442 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  38.07 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.9 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 		 569 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.89 
 
 		 450 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  40.23 
 
 		 438 aa  216  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 742 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  36.34 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  35.2 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  38.36 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.95 
 
 		 624 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  36.24 
 
 		 589 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  35.5 
 
 		 454 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 449 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  39.44 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  37.82 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 440 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  37.82 
 
 		 520 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  37.82 
 
 		 520 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  37.82 
 
 		 520 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  37.82 
 
 		 521 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  37.82 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  37.79 
 
 		 474 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  40.25 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  36.93 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  38.66 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  38.49 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 496 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  36.39 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  36.39 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.68 
 
 		 521 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  36.39 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.22 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.51 
 
 		 638 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 488 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  37.23 
 
 		 634 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.14 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 482 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  36.84 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  35.2 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>