More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6894 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  100 
 
 		 456 aa  905    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  51.16 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  45.5 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  43.82 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  43.13 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  47.17 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  39.35 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 440 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  39.52 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  40.06 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 449 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.22 
 
 		 624 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.13 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 455 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  39.77 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  39.77 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  39.77 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.5 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.85 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 523 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  36.98 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  35.54 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  38.35 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 487 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 467 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 485 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  34.34 
 
 		 589 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  42.32 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  42.32 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.45 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  34.2 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.16 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.39 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  33 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.32 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  36.87 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 478 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 491 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  35.91 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 458 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 508 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  33.88 
 
 		 433 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 483 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 469 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  37.15 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  37.15 
 
 		 521 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 457 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  37.15 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  37.15 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  37.15 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  37.15 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  37.15 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 608 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>