More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5226 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  100 
 
 		 332 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5468  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0233856 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  39.03 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  38.38 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 521 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.63 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 463 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.82 
 
 		 441 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.71 
 
 		 478 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  36.01 
 
 		 589 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  31.6 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 474 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 521 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  36.88 
 
 		 520 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  36.88 
 
 		 521 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  36.88 
 
 		 520 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  36.88 
 
 		 520 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  36.88 
 
 		 523 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  36.88 
 
 		 523 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  35.35 
 
 		 432 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  36.54 
 
 		 515 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  36.64 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  36.24 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  35.76 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  30.09 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  34.64 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  34.9 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 473 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.2 
 
 		 487 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.82 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 463 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 442 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.99 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  35.66 
 
 		 569 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 472 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  29.39 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 472 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  29.39 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.95 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  35.6 
 
 		 498 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.76 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 472 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 478 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  36 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  34.08 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  34.12 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 491 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 500 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  35.59 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  35.54 
 
 		 457 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 482 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  33.67 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  34.22 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 465 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 470 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  34.22 
 
 		 482 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 491 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 485 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 491 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 639 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 471 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  34.74 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 482 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  33.33 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.9 
 
 		 594 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  34.16 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  35.02 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 508 aa  165  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  35.79 
 
 		 477 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.39 
 
 		 638 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.27 
 
 		 484 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  34.9 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33.67 
 
 		 634 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  33.92 
 
 		 489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>