More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2817 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  100 
 
 		 349 aa  720    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 349 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 349 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  36.09 
 
 		 634 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.87 
 
 		 444 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  35.1 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  35.1 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.65 
 
 		 572 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  35.14 
 
 		 638 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 639 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  36.14 
 
 		 569 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 463 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  36.47 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  34.64 
 
 		 491 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 465 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  35.24 
 
 		 589 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.89 
 
 		 467 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  35.93 
 
 		 441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.89 
 
 		 466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.61 
 
 		 594 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 469 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 455 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  35.63 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.74 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.35 
 
 		 452 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 472 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  36.14 
 
 		 472 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.89 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 469 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 423 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  33.05 
 
 		 446 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.89 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  36.14 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 473 aa  183  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 479 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 468 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 471 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  33.43 
 
 		 563 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.73 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  34.26 
 
 		 472 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  33.53 
 
 		 449 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.52 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.23 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 491 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 454 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 463 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 454 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 521 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  33.72 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 452 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0882  type II secretion system protein E  34.58 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 468 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.33 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  32.31 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 476 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  34.99 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 447 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.21 
 
 		 447 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  32.21 
 
 		 447 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  32.31 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.21 
 
 		 447 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  32.31 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.95 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 498 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>