More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5606 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  100 
 
 
348 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  78.96 
 
 
376 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  68.66 
 
 
349 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  68.66 
 
 
349 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  62.87 
 
 
349 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
343 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
343 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
332 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.15 
 
 
444 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.66 
 
 
463 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  34.89 
 
 
433 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
485 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  34.58 
 
 
467 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
331 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.53 
 
 
453 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.71 
 
 
441 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
484 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
572 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
411 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
508 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
489 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
442 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.62 
 
 
447 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.46 
 
 
472 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32.4 
 
 
563 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
477 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  34.8 
 
 
482 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
488 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
482 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
476 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
438 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  34.38 
 
 
469 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
459 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.69 
 
 
440 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
483 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35 
 
 
438 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.12 
 
 
569 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  34.28 
 
 
485 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
469 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.52 
 
 
454 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
462 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
450 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
450 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.31 
 
 
450 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
469 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
482 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
491 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  32.62 
 
 
521 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  32.62 
 
 
520 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  32.62 
 
 
515 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  32.62 
 
 
520 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
454 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  32.62 
 
 
520 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  32.02 
 
 
479 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  32.62 
 
 
523 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.52 
 
 
634 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.24 
 
 
455 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  32.09 
 
 
638 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
482 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.02 
 
 
440 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.7 
 
 
487 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.97 
 
 
589 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  32.62 
 
 
523 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  32.95 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  35.62 
 
 
450 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  31.5 
 
 
423 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
491 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  30.83 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  31.97 
 
 
423 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  30.87 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  34.46 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  34.46 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
488 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  34.46 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.22 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.72 
 
 
624 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.71 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.47 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  30.61 
 
 
478 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  34.83 
 
 
404 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
447 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  30.61 
 
 
477 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  33.52 
 
 
742 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  35.59 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
473 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
428 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.46 
 
 
428 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.46 
 
 
428 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>