More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5421 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  100 
 
 		 343 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  100 
 
 		 343 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  37.76 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  37.76 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  36.09 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  35.38 
 
 		 569 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.31 
 
 		 479 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  36.06 
 
 		 594 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  34.9 
 
 		 572 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 411 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.19 
 
 		 455 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 460 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  35.44 
 
 		 589 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.14 
 
 		 634 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.09 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  34.53 
 
 		 563 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 498 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 456 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.44 
 
 		 453 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 469 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 472 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 468 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 521 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 457 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.53 
 
 		 638 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.08 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 624 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  35.78 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 521 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  35.76 
 
 		 469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  34.53 
 
 		 455 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.49 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  33.04 
 
 		 459 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.97 
 
 		 447 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 464 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  35.87 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 466 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 472 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 463 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.98 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  33.71 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  35.62 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 482 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  40.44 
 
 		 483 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 442 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  36.28 
 
 		 474 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 639 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  34.02 
 
 		 455 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.16 
 
 		 451 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  36.61 
 
 		 440 aa  175  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  34.59 
 
 		 523 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  34.59 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.72 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  34.59 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  34.59 
 
 		 520 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 416 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  33.72 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  34.59 
 
 		 520 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  34.59 
 
 		 523 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  34.59 
 
 		 520 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  34.73 
 
 		 560 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.85 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  35.35 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  34.92 
 
 		 452 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 480 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  35.45 
 
 		 450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  40.08 
 
 		 491 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 482 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  40.74 
 
 		 485 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 465 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>