More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1525 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  100 
 
 		 349 aa  719    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  100 
 
 		 349 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  68.73 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  68.59 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5606  type II secretion system protein E  68.66 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.916826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 349 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  37.76 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  37.76 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  36.61 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 412 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  37.27 
 
 		 433 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 467 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 477 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 484 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  36.06 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  36.67 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  32.86 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.74 
 
 		 441 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  34.12 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 485 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  34.83 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 624 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 462 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 468 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.93 
 
 		 589 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  33.23 
 
 		 563 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  35.87 
 
 		 454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.38 
 
 		 447 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.74 
 
 		 460 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  34.28 
 
 		 469 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 469 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 472 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.53 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  35.26 
 
 		 456 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 481 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 474 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  34.06 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 479 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 442 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  33.15 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  33.75 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.38 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 476 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  32.02 
 
 		 572 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 480 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.92 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 445 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.06 
 
 		 482 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 440 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  35.4 
 
 		 452 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.71 
 
 		 454 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.02 
 
 		 569 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 452 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 485 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  34.95 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 482 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 416 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  35.26 
 
 		 455 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 491 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.24 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  36.11 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.95 
 
 		 463 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 482 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  36.25 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.95 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  33.06 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  33.06 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  33.06 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  36.25 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 449 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 508 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 455 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>