More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5468 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5468  type II secretion system protein E  100 
 
 		 324 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0233856 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4744  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.332576 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 632 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 632 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4263  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 463 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.19 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.08 
 
 		 444 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.19 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  34.34 
 
 		 572 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  34.68 
 
 		 589 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  34.38 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  34.38 
 
 		 520 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 449 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  34.38 
 
 		 520 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  34.38 
 
 		 520 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  34.38 
 
 		 523 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  34.38 
 
 		 523 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 472 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  34.06 
 
 		 515 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  36.65 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 463 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.11 
 
 		 569 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 639 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.7 
 
 		 474 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 467 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 490 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5630  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00466879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 462 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 455 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 482 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.11 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 484 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  32.67 
 
 		 466 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.44 
 
 		 482 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.43 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  32.34 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 485 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.43 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  33.43 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 489 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  35.13 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 491 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 487 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  33.75 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  34.81 
 
 		 482 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6302  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 480 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.07 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.21 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7229  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0403713  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5421  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5016  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  33.86 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 474 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 404 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  33.64 
 
 		 432 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.2 
 
 		 463 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 479 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 442 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 491 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.18 
 
 		 491 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  32.74 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  32.74 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.57 
 
 		 634 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  36.86 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 485 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 513 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  30.72 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  37.95 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 442 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 		 563 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 477 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 473 aa  159  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  36.51 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  34.53 
 
 		 488 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6509  type II secretion system protein E  33.95 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 477 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  36.79 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  31.91 
 
 		 638 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.16 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.31 
 
 		 430 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 478 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.1 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>