More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7229 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5630  type II secretion system protein E  94.74 
 
 		 380 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00466879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7229  type II secretion system protein E  100 
 
 		 380 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0403713  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  46.31 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  45.92 
 
 		 463 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  45.92 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  44.07 
 
 		 572 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  45.33 
 
 		 513 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  47.49 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  49 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.45 
 
 		 472 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  48.37 
 
 		 467 aa  295  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  47.35 
 
 		 432 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  43.38 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  43.88 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  45.87 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  48.09 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  43.41 
 
 		 638 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  43.5 
 
 		 463 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.66 
 
 		 634 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  44.18 
 
 		 428 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  46.07 
 
 		 465 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  43.71 
 
 		 589 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  45.07 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  48.96 
 
 		 437 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  46.87 
 
 		 441 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 454 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  44.1 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 467 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  44.38 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  42.18 
 
 		 563 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 466 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 472 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  44.01 
 
 		 594 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.22 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  44.41 
 
 		 451 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  43.79 
 
 		 520 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  43.79 
 
 		 520 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  43.79 
 
 		 520 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  44.25 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  43.79 
 
 		 523 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  43.79 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  43.79 
 
 		 523 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  43.79 
 
 		 474 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.96 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  45.37 
 
 		 624 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  45.96 
 
 		 491 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  43.49 
 
 		 515 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  45.99 
 
 		 416 aa  278  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  47.32 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  45.07 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  45.34 
 
 		 478 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 632 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.37 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 632 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.07 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.07 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  43.52 
 
 		 639 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  45.3 
 
 		 449 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  45 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  43.58 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  48.45 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  45.37 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  44.79 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  44.05 
 
 		 468 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  45.57 
 
 		 608 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  44.73 
 
 		 440 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  44.9 
 
 		 455 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  44.11 
 
 		 452 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 454 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  47.01 
 
 		 437 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  44.12 
 
 		 423 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  47.35 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 457 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  44.89 
 
 		 471 aa  272  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  47.32 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  43.68 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 449 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  45.78 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 677 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 471 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 455 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  43.42 
 
 		 428 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  43.42 
 
 		 428 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  43.42 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  45.71 
 
 		 438 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  44.51 
 
 		 463 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  44.25 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  44.57 
 
 		 568 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>