More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0892 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  100 
 
 		 319 aa  640    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  80.5 
 
 		 319 aa  541  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.16 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.37 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.37 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.45 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.33 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.12 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.2 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.87 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.41 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.51 
 
 		 333 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  40.66 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.25 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.25 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  41.3 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.83 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.59 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.17 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.54 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  41.06 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  41.75 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.46 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  39.41 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  40.92 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  40.88 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.67 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.33 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  39.16 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.33 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.33 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  40 
 
 		 354 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  40 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  42.35 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40 
 
 		 350 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.61 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  40 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  40.33 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.94 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.03 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.96 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.79 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.93 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  40.64 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  41.37 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  40.21 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  39.55 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.54 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  37.42 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  37.42 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  39.93 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.03 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  38.44 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  37.46 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.22 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  40.75 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.29 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  36.33 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  36.33 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.99 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.6 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  34.8 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 412 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 467 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  31.25 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 465 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.43 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 464 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 449 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 455 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.97 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  30.13 
 
 		 432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  33.22 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.13 
 
 		 451 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  30.31 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>