More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0128 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  100 
 
 
513 aa  1039    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  72.78 
 
 
512 aa  785    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.53 
 
 
604 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
617 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
610 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  43.82 
 
 
547 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  39.81 
 
 
618 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
620 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  43.2 
 
 
546 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  46.43 
 
 
622 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  47.13 
 
 
546 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
549 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  42.4 
 
 
546 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  46.3 
 
 
546 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  43.71 
 
 
543 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
557 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  37.12 
 
 
559 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  37.38 
 
 
557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  37.48 
 
 
557 aa  333  4e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.79 
 
 
557 aa  333  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  41 
 
 
547 aa  310  5e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  36.42 
 
 
749 aa  300  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
682 aa  299  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  37.31 
 
 
791 aa  299  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.97 
 
 
545 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  35.73 
 
 
609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  36.02 
 
 
628 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
797 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  36.4 
 
 
558 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  35.6 
 
 
654 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
549 aa  267  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.6 
 
 
510 aa  265  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
542 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  37.27 
 
 
556 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  37.61 
 
 
692 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
640 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  35.76 
 
 
549 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  42.03 
 
 
991 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  33.46 
 
 
722 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.98 
 
 
519 aa  250  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  37.53 
 
 
591 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.18 
 
 
583 aa  248  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  40 
 
 
671 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  37.97 
 
 
551 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  34.35 
 
 
1255 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
847 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.58 
 
 
770 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
831 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.86 
 
 
577 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  37.54 
 
 
491 aa  221  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.87 
 
 
489 aa  219  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  35.57 
 
 
1335 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.39 
 
 
492 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
1319 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.12 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  39.92 
 
 
612 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.83 
 
 
572 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
473 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  39.17 
 
 
311 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  37.12 
 
 
515 aa  166  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.57 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
476 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  29.91 
 
 
483 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.52 
 
 
411 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  29.95 
 
 
521 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
472 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  35.46 
 
 
513 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.72 
 
 
444 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.83 
 
 
458 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
544 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
468 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  31.4 
 
 
552 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  36.12 
 
 
478 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
498 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
548 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  32.74 
 
 
482 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  33.33 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  31.4 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.79 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32.74 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  33.9 
 
 
624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.81 
 
 
480 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  32.44 
 
 
485 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  36.2 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  32.94 
 
 
482 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
490 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.01 
 
 
453 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  32.54 
 
 
483 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>