More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1183 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  100 
 
 		 319 aa  642    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  80.5 
 
 		 319 aa  541  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.49 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.75 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.96 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.82 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  40.55 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  40.61 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.61 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.41 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.18 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.76 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  40 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.47 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  40.75 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.8 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.13 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.47 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.47 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.65 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.56 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  42.53 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.73 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  39.8 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 327 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 358 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  40 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.67 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  41.75 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.41 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  40.13 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  39.66 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  38.89 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.73 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  39.38 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.73 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.7 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.45 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.47 
 
 		 345 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 356 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  40.48 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.97 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  39.13 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.57 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.88 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.64 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.36 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.55 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  40.64 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  38.85 
 
 		 325 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  41.16 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  40.07 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  40.07 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.01 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.62 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  38.08 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  37.37 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  38.49 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  39.24 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.19 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  37.89 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  36.65 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  37.5 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.43 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  36.08 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  34.19 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  35.05 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  34.36 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.65 
 
 		 465 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.31 
 
 		 463 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 467 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  32.47 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.52 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  31.88 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  30.45 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.86 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 455 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.78 
 
 		 441 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 464 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.74 
 
 		 453 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.72 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 452 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.1 
 
 		 474 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>