More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0179 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  692    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  97.01 
 
 
334 aa  678    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  41.9 
 
 
331 aa  228  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
342 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  41.77 
 
 
330 aa  226  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  40 
 
 
332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  38.44 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  37.77 
 
 
340 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  38.32 
 
 
343 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  41.77 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.32 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.76 
 
 
342 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  36.53 
 
 
344 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  36.22 
 
 
343 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.01 
 
 
349 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.69 
 
 
343 aa  205  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  36.83 
 
 
438 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.98 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.14 
 
 
447 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
450 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
450 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
450 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
487 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  34.88 
 
 
361 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  34.19 
 
 
447 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  34.19 
 
 
447 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  34.19 
 
 
447 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
417 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.54 
 
 
342 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
462 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.5 
 
 
446 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  33.55 
 
 
450 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  34.5 
 
 
469 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  34.39 
 
 
624 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  31.25 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.95 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.87 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
465 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.19 
 
 
453 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  32.8 
 
 
444 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
444 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
455 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
447 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
455 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.91 
 
 
474 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
440 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.45 
 
 
368 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
408 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
452 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
454 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
454 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
454 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
460 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
450 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
477 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.89 
 
 
357 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5190  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
349 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1525  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
349 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  35.18 
 
 
445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.48 
 
 
472 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 
441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  31.63 
 
 
449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.8 
 
 
473 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
469 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
472 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
472 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  34.3 
 
 
428 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.63 
 
 
408 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  34.3 
 
 
428 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
454 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.86 
 
 
478 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  34.6 
 
 
569 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  32.27 
 
 
520 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.56 
 
 
634 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  32.27 
 
 
520 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  32.27 
 
 
520 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  32.27 
 
 
521 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  33.01 
 
 
462 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  32.27 
 
 
515 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
521 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  32.27 
 
 
523 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  35.24 
 
 
638 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
468 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  32.27 
 
 
523 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.27 
 
 
451 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.59 
 
 
472 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.7 
 
 
438 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  34.2 
 
 
423 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
444 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
498 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>