More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1537 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
583 aa  1210    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  52.51 
 
 
991 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  52.14 
 
 
692 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  43.63 
 
 
797 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  44.35 
 
 
549 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  41.96 
 
 
556 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  40.96 
 
 
558 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  45.41 
 
 
591 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  42.64 
 
 
549 aa  388  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
628 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  41.72 
 
 
682 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
609 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  42.76 
 
 
551 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
749 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  43.61 
 
 
770 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.18 
 
 
640 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  42.52 
 
 
791 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  42.14 
 
 
654 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  41.07 
 
 
1319 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
547 aa  354  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  47.03 
 
 
1335 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
847 aa  345  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  46.63 
 
 
1255 aa  340  4e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  44.96 
 
 
831 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
510 aa  326  9e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
722 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
519 aa  298  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  49.31 
 
 
612 aa  296  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  43.64 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  43.28 
 
 
604 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
671 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  42.9 
 
 
618 aa  271  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
549 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  43.36 
 
 
617 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  42.9 
 
 
622 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
620 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  39.76 
 
 
512 aa  252  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
489 aa  250  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
610 aa  251  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  33.62 
 
 
546 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
546 aa  247  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  40.18 
 
 
513 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  33.05 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  38.95 
 
 
543 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.83 
 
 
492 aa  243  9e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.83 
 
 
492 aa  242  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.11 
 
 
557 aa  233  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.52 
 
 
557 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.66 
 
 
572 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  38.12 
 
 
577 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
557 aa  229  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  31.89 
 
 
552 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.21 
 
 
548 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  39.27 
 
 
559 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
552 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
544 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
553 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
553 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
553 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
553 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.07 
 
 
473 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.93 
 
 
311 aa  182  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.96 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
440 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  36.88 
 
 
430 aa  177  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.09 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.56 
 
 
449 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.72 
 
 
479 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
467 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
447 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.56 
 
 
445 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
460 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  33.23 
 
 
447 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  33.23 
 
 
447 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.54 
 
 
469 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  33.23 
 
 
447 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.05 
 
 
515 aa  170  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.13 
 
 
453 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
469 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  29.13 
 
 
442 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  33.33 
 
 
446 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  34.83 
 
 
523 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.73 
 
 
521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.13 
 
 
447 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.73 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.73 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.73 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.73 
 
 
523 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
462 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
515 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>