More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1640 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  100 
 
 
552 aa  1132    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  83.06 
 
 
553 aa  941    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  92.75 
 
 
552 aa  1042    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  91.12 
 
 
548 aa  1021    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  83.06 
 
 
553 aa  941    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  83.06 
 
 
553 aa  941    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  83.06 
 
 
553 aa  941    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  62.91 
 
 
544 aa  662    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
797 aa  266  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  32.94 
 
 
510 aa  264  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  37.56 
 
 
692 aa  249  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
628 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
640 aa  246  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  33.57 
 
 
547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  31.97 
 
 
583 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
549 aa  239  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  34.76 
 
 
558 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
551 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  33.57 
 
 
556 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.49 
 
 
682 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  36.58 
 
 
549 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
791 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
472 aa  230  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
591 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  31.38 
 
 
749 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  34.01 
 
 
654 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  33.5 
 
 
542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
545 aa  226  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
671 aa  226  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  29.18 
 
 
519 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
438 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  38.15 
 
 
991 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
1319 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  33.16 
 
 
1335 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35 
 
 
547 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
445 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  38.11 
 
 
504 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
1255 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
847 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
477 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  32.93 
 
 
770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  42.24 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.31 
 
 
440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  35.05 
 
 
438 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  43.44 
 
 
479 aa  213  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
482 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
463 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.77 
 
 
438 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
482 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.59 
 
 
468 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
465 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.13 
 
 
464 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
489 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  38.72 
 
 
441 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
487 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
521 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  37.89 
 
 
508 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
483 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
482 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  41.07 
 
 
477 aa  210  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.92 
 
 
482 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
488 aa  209  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
485 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  36.16 
 
 
450 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.77 
 
 
444 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  33.16 
 
 
831 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
470 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.1 
 
 
460 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  35.89 
 
 
451 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
463 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.12 
 
 
467 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
478 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  35.89 
 
 
451 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
488 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.2 
 
 
455 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  38.2 
 
 
455 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  40.17 
 
 
421 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  38.2 
 
 
455 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  35.58 
 
 
433 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
454 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  38.2 
 
 
455 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
467 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
490 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  38.21 
 
 
421 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
485 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.62 
 
 
452 aa  207  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  44.23 
 
 
677 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
476 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  42.19 
 
 
473 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
455 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
447 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  36.03 
 
 
455 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
484 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
491 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  35.7 
 
 
489 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  36.03 
 
 
455 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
492 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>