More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2386 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  100 
 
 
692 aa  1413    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  54.11 
 
 
991 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  52.14 
 
 
583 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.95 
 
 
640 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  44.92 
 
 
591 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  42.51 
 
 
551 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  40.08 
 
 
547 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  43.63 
 
 
549 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  43.53 
 
 
556 aa  389  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
797 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
542 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  42.79 
 
 
749 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  40.5 
 
 
558 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  43.81 
 
 
682 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  43.02 
 
 
549 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
628 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  41.65 
 
 
609 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  42.79 
 
 
791 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  41.81 
 
 
654 aa  361  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  42.02 
 
 
770 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
1255 aa  347  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  45.43 
 
 
1319 aa  340  5.9999999999999996e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40 
 
 
545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  45.82 
 
 
831 aa  337  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  45.43 
 
 
1335 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
847 aa  333  5e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
722 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  50.36 
 
 
612 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  35.76 
 
 
510 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.69 
 
 
604 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
671 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
547 aa  272  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
519 aa  271  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.25 
 
 
559 aa  267  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  38.6 
 
 
610 aa  266  8e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  40.87 
 
 
618 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  39 
 
 
620 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
617 aa  263  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
513 aa  259  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
512 aa  256  9e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  36.13 
 
 
549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
489 aa  254  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
622 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  35.45 
 
 
557 aa  253  7e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  34.8 
 
 
557 aa  250  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  37.26 
 
 
557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
544 aa  243  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
546 aa  243  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
546 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
546 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  37.19 
 
 
546 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  35.33 
 
 
543 aa  238  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
491 aa  234  6e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
492 aa  233  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.56 
 
 
492 aa  231  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  37.56 
 
 
552 aa  229  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
552 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  36.6 
 
 
577 aa  228  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  37.56 
 
 
548 aa  227  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
553 aa  223  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
553 aa  223  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
553 aa  223  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
553 aa  223  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
572 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
440 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  39.63 
 
 
438 aa  191  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  41.76 
 
 
438 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  43.02 
 
 
455 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  41.49 
 
 
469 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  41.13 
 
 
469 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  42.19 
 
 
447 aa  187  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  41.86 
 
 
447 aa  187  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
450 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
450 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
450 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  41.02 
 
 
454 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  33.24 
 
 
473 aa  185  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
442 aa  184  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  41.86 
 
 
446 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
311 aa  183  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  41.47 
 
 
450 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
444 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  41.86 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  41.86 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  41.86 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
476 aa  181  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  41.09 
 
 
451 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  41.09 
 
 
451 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  29.55 
 
 
491 aa  180  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  35.09 
 
 
563 aa  180  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
472 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.47 
 
 
594 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.45 
 
 
473 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
463 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  31.25 
 
 
634 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
624 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
438 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  32.74 
 
 
462 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>