More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0448 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  100 
 
 
797 aa  1635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  52.66 
 
 
609 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  50.94 
 
 
791 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  51.64 
 
 
749 aa  550  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  51.87 
 
 
682 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  50.87 
 
 
654 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  46.32 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  49.7 
 
 
549 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  46.8 
 
 
542 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  47.36 
 
 
591 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  47.09 
 
 
551 aa  490  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
549 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  44.19 
 
 
558 aa  485  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  47.8 
 
 
628 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
640 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  43.2 
 
 
1319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
1335 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
847 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
831 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  43.45 
 
 
547 aa  444  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  50.9 
 
 
1255 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.63 
 
 
583 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  42.47 
 
 
770 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  44.83 
 
 
545 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
692 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  48.19 
 
 
991 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.84 
 
 
612 aa  361  4e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
510 aa  348  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.25 
 
 
519 aa  337  5.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
722 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.58 
 
 
671 aa  323  7e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.47 
 
 
547 aa  286  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  35.5 
 
 
549 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  43.23 
 
 
604 aa  281  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  41.13 
 
 
617 aa  280  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
618 aa  279  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
513 aa  274  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
512 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
489 aa  270  8.999999999999999e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  37.11 
 
 
620 aa  269  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  37.56 
 
 
546 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
610 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  38.34 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
557 aa  263  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  41.35 
 
 
622 aa  262  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  38.08 
 
 
546 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
546 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
557 aa  260  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.49 
 
 
559 aa  258  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.85 
 
 
543 aa  258  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  31.95 
 
 
557 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.95 
 
 
557 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
548 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
552 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
491 aa  243  7e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.6 
 
 
577 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
492 aa  243  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
492 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
552 aa  241  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
544 aa  238  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
553 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
553 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
553 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
553 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  29.62 
 
 
572 aa  223  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
515 aa  187  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
311 aa  183  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.92 
 
 
476 aa  182  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
473 aa  180  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.67 
 
 
438 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.92 
 
 
440 aa  174  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.94 
 
 
438 aa  174  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.59 
 
 
634 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
467 aa  170  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
465 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
463 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
440 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
430 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32.6 
 
 
563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
454 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.54 
 
 
469 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  33.54 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  30.62 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.3 
 
 
412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
469 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  33.33 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.44 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
491 aa  164  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
480 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.47 
 
 
477 aa  164  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  33.23 
 
 
450 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.72 
 
 
447 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
487 aa  163  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  29.27 
 
 
483 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.72 
 
 
447 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>