More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2003 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  66.61 
 
 
749 aa  865    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  73.18 
 
 
609 aa  810    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  63.62 
 
 
682 aa  830    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  100 
 
 
791 aa  1617    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  54.1 
 
 
654 aa  601  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  48.94 
 
 
797 aa  552  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  49.19 
 
 
547 aa  510  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
549 aa  485  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  47.33 
 
 
549 aa  477  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
640 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  47.59 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
542 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  46.14 
 
 
591 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
628 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  44.19 
 
 
556 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  52.82 
 
 
1255 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  43.68 
 
 
558 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
1335 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  42.33 
 
 
831 aa  431  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  44.47 
 
 
551 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  42.62 
 
 
1319 aa  432  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
847 aa  428  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.82 
 
 
722 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.52 
 
 
583 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  42.79 
 
 
692 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  40.24 
 
 
770 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
510 aa  349  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.75 
 
 
991 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
612 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
519 aa  331  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
671 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  38.64 
 
 
604 aa  295  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  37.23 
 
 
513 aa  291  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  35.06 
 
 
549 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  39.39 
 
 
617 aa  281  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.7 
 
 
512 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.04 
 
 
618 aa  273  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
547 aa  273  7e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.43 
 
 
543 aa  270  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
557 aa  266  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38 
 
 
622 aa  266  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
546 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  37.41 
 
 
620 aa  265  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
546 aa  264  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
546 aa  264  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  33.08 
 
 
546 aa  263  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
557 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.2 
 
 
492 aa  259  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  37.69 
 
 
610 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.2 
 
 
492 aa  258  4e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
557 aa  253  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
559 aa  252  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
557 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
489 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
491 aa  241  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  28.72 
 
 
572 aa  234  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  28.99 
 
 
577 aa  227  7e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
552 aa  210  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
548 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
552 aa  208  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.66 
 
 
544 aa  207  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
473 aa  188  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
311 aa  187  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  37.23 
 
 
430 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.16 
 
 
453 aa  173  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30 
 
 
476 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.17 
 
 
515 aa  171  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  32.59 
 
 
449 aa  170  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
474 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  34.42 
 
 
445 aa  168  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
472 aa  167  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.48 
 
 
479 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.62 
 
 
498 aa  165  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  29.26 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  30.34 
 
 
485 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
482 aa  165  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  29.26 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  29.26 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  29.82 
 
 
521 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  29.82 
 
 
523 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  29.82 
 
 
523 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  29.72 
 
 
472 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
481 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  28.03 
 
 
489 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
463 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
500 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.74 
 
 
594 aa  163  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  29.01 
 
 
515 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
445 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  32.31 
 
 
408 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.28 
 
 
454 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28.61 
 
 
508 aa  162  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  32.96 
 
 
454 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  29.7 
 
 
634 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
438 aa  161  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>