More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0352 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  100 
 
 
610 aa  1246    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  52.11 
 
 
618 aa  644    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  52.93 
 
 
617 aa  657    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  53.31 
 
 
620 aa  628  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  52.12 
 
 
622 aa  629  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  51.83 
 
 
604 aa  610  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  42.69 
 
 
512 aa  413  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
546 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  43.41 
 
 
546 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  42.93 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  49.01 
 
 
513 aa  403  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  42 
 
 
546 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
549 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  42.04 
 
 
543 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
547 aa  385  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
557 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.57 
 
 
559 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  33.92 
 
 
557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.28 
 
 
557 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  33.92 
 
 
557 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  40.78 
 
 
547 aa  302  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.44 
 
 
671 aa  292  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  38.14 
 
 
545 aa  287  5e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
628 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
609 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  39.35 
 
 
640 aa  277  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  39.74 
 
 
654 aa  277  4e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  36.25 
 
 
682 aa  277  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  37.11 
 
 
549 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
542 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  40.35 
 
 
831 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.27 
 
 
549 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  42.05 
 
 
847 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.33 
 
 
591 aa  270  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
749 aa  270  7e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  40 
 
 
1255 aa  270  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  34.11 
 
 
556 aa  269  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
519 aa  266  8.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  41.58 
 
 
797 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
791 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  38.18 
 
 
551 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  39.8 
 
 
1335 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.25 
 
 
583 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  36.27 
 
 
770 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
1319 aa  253  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  35.66 
 
 
558 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.57 
 
 
991 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
722 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.96 
 
 
612 aa  240  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
577 aa  229  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
572 aa  216  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
492 aa  213  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
489 aa  206  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
544 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
548 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.78 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.11 
 
 
311 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.47 
 
 
552 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30 
 
 
473 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  41.41 
 
 
412 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.48 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
463 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.84 
 
 
515 aa  156  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.3 
 
 
440 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
411 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
466 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.16 
 
 
467 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.93 
 
 
451 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
438 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
521 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
452 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.75 
 
 
472 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
450 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.02 
 
 
491 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  34.71 
 
 
428 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
478 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
452 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
444 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
482 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
482 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.7 
 
 
491 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
485 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.83 
 
 
479 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
483 aa  150  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
481 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
504 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
480 aa  150  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.4 
 
 
445 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.49 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.59 
 
 
446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.82 
 
 
498 aa  147  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>