More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0104 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  65.75 
 
 
617 aa  863    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  100 
 
 
620 aa  1274    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  63.45 
 
 
622 aa  805    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  63.71 
 
 
618 aa  822    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  53.31 
 
 
610 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  50.95 
 
 
604 aa  591  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  43.03 
 
 
546 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  43.08 
 
 
546 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  41.84 
 
 
546 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  42.15 
 
 
549 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
513 aa  395  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  49.75 
 
 
512 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
547 aa  392  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  40.53 
 
 
543 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  36 
 
 
557 aa  362  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.89 
 
 
559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
557 aa  346  8.999999999999999e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  33.45 
 
 
557 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
557 aa  339  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  40.26 
 
 
547 aa  293  6e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  40.05 
 
 
609 aa  289  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  41.65 
 
 
549 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
628 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  42.69 
 
 
551 aa  286  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  39.16 
 
 
654 aa  286  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
682 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
542 aa  281  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
749 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  37.11 
 
 
797 aa  274  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  38.29 
 
 
545 aa  273  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  36.64 
 
 
558 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
791 aa  272  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
556 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.52 
 
 
831 aa  271  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  42.43 
 
 
591 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
640 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  39 
 
 
692 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
549 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
847 aa  260  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  41.74 
 
 
1255 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  32.53 
 
 
671 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  41.99 
 
 
1335 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  33.88 
 
 
510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 
583 aa  253  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  41.44 
 
 
1319 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  36.43 
 
 
991 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
519 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  36.58 
 
 
770 aa  239  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  30.98 
 
 
722 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.36 
 
 
612 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.9 
 
 
491 aa  203  9e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.7 
 
 
577 aa  200  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.92 
 
 
572 aa  198  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
492 aa  195  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29.22 
 
 
489 aa  174  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.08 
 
 
544 aa  162  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.25 
 
 
548 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  28.43 
 
 
473 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
552 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
552 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.62 
 
 
476 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
553 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
553 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
553 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
553 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
311 aa  153  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
492 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
466 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  30.13 
 
 
515 aa  151  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
478 aa  152  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
467 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  33.43 
 
 
458 aa  151  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  32.37 
 
 
491 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
411 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
463 aa  150  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
491 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
412 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  31.63 
 
 
492 aa  147  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  36.25 
 
 
428 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
521 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  31.28 
 
 
488 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  31.23 
 
 
480 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.34 
 
 
444 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.86 
 
 
440 aa  143  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.15 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.15 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.01 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
504 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.92 
 
 
467 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
463 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.4 
 
 
484 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
490 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  30.68 
 
 
488 aa  140  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  30.71 
 
 
433 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  32.82 
 
 
485 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>