More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2400 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  100 
 
 
549 aa  1125    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  52.22 
 
 
558 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  51.9 
 
 
628 aa  543  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  50.96 
 
 
640 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  50.19 
 
 
549 aa  525  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  49.7 
 
 
797 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  47.74 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  45.61 
 
 
556 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  45.79 
 
 
609 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  48.32 
 
 
654 aa  475  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  47.07 
 
 
551 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  47.33 
 
 
791 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  46.71 
 
 
682 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  46.22 
 
 
749 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  47.34 
 
 
591 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
547 aa  468  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
1335 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  40.98 
 
 
1319 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
545 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  41.63 
 
 
770 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.35 
 
 
583 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  48.62 
 
 
1255 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.63 
 
 
692 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  38.14 
 
 
831 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  46.41 
 
 
847 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  44.84 
 
 
991 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.2 
 
 
722 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
510 aa  329  9e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
519 aa  323  6e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
612 aa  300  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.58 
 
 
604 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  40.87 
 
 
620 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  39.85 
 
 
617 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.01 
 
 
512 aa  267  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
618 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
622 aa  263  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.98 
 
 
547 aa  259  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.31 
 
 
492 aa  259  7e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.31 
 
 
492 aa  259  7e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  37.34 
 
 
549 aa  256  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  37.68 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  34.03 
 
 
577 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
572 aa  249  7e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
546 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
546 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
546 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
546 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29.47 
 
 
489 aa  243  6e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.62 
 
 
557 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
557 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
543 aa  236  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
557 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
559 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.14 
 
 
552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  35.29 
 
 
473 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.28 
 
 
544 aa  205  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.14 
 
 
311 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
476 aa  177  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
515 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  30.64 
 
 
449 aa  172  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.73 
 
 
412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
440 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.75 
 
 
594 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
417 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.75 
 
 
438 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  32.56 
 
 
440 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.09 
 
 
428 aa  160  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.09 
 
 
428 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.97 
 
 
463 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
428 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
447 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.88 
 
 
472 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
451 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.13 
 
 
469 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
451 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
455 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  37.26 
 
 
454 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.84 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.04 
 
 
447 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  32.42 
 
 
450 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.26 
 
 
465 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  33.53 
 
 
447 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  33.53 
 
 
447 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.29 
 
 
442 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  33.53 
 
 
447 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
450 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.19 
 
 
438 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
450 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
450 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
469 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>