More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0978 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  65.15 
 
 
1319 aa  1038    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  66.03 
 
 
831 aa  1016    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  62.56 
 
 
612 aa  741    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  64.33 
 
 
847 aa  991    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  66.88 
 
 
1335 aa  1046    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  100 
 
 
1255 aa  2499    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  50.9 
 
 
797 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  52.82 
 
 
791 aa  438  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  49.41 
 
 
749 aa  432  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  48.93 
 
 
682 aa  429  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  50.62 
 
 
609 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  38.07 
 
 
558 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  51.29 
 
 
591 aa  399  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  47.95 
 
 
556 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  47.54 
 
 
551 aa  396  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  49.23 
 
 
542 aa  393  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  48.62 
 
 
549 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.35 
 
 
549 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  47.36 
 
 
547 aa  383  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
654 aa  383  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
640 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  45.39 
 
 
628 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
692 aa  346  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.35 
 
 
583 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  44.39 
 
 
770 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  41.87 
 
 
991 aa  335  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
545 aa  321  6e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.38 
 
 
510 aa  295  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
722 aa  293  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.16 
 
 
519 aa  278  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  42.17 
 
 
604 aa  278  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
671 aa  273  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
617 aa  271  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  41.57 
 
 
618 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
622 aa  267  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  39.74 
 
 
610 aa  267  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
546 aa  255  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
546 aa  254  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  41.46 
 
 
620 aa  254  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  38.07 
 
 
546 aa  254  9.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  37.82 
 
 
546 aa  251  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.28 
 
 
547 aa  251  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  36.04 
 
 
557 aa  250  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
549 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
557 aa  245  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
543 aa  243  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  35.44 
 
 
491 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
559 aa  240  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
513 aa  237  8e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
492 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
557 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.02 
 
 
512 aa  236  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
557 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
492 aa  234  9e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.82 
 
 
577 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
572 aa  219  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.03 
 
 
489 aa  208  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
552 aa  199  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.05 
 
 
548 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.18 
 
 
311 aa  196  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
552 aa  196  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
544 aa  194  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
553 aa  190  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
553 aa  190  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
553 aa  190  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
553 aa  190  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
473 aa  167  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.14 
 
 
476 aa  161  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
515 aa  159  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
452 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
450 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.88 
 
 
491 aa  154  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.64 
 
 
442 aa  152  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.59 
 
 
451 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.41 
 
 
440 aa  151  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.68 
 
 
463 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
460 aa  149  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
624 aa  148  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
449 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  31.03 
 
 
453 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.86 
 
 
467 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
456 aa  146  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
483 aa  146  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  30.86 
 
 
452 aa  144  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
487 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
408 aa  144  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
444 aa  144  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.4 
 
 
472 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.64 
 
 
455 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.91 
 
 
467 aa  144  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.88 
 
 
634 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  31.49 
 
 
560 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
463 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  32.3 
 
 
454 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.33 
 
 
455 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
445 aa  142  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.48 
 
 
594 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
454 aa  142  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
454 aa  142  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
454 aa  142  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>