More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1318 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  100 
 
 
547 aa  1114    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  56.27 
 
 
549 aa  621  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  54.58 
 
 
543 aa  608  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  53.93 
 
 
546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  54.75 
 
 
546 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  54.71 
 
 
546 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  54.93 
 
 
546 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  50.37 
 
 
557 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  50.37 
 
 
557 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  49.26 
 
 
557 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  47.61 
 
 
557 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  47.79 
 
 
559 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  42.38 
 
 
604 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  44.3 
 
 
512 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
617 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
618 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  44.31 
 
 
513 aa  385  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  40.52 
 
 
620 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  38.72 
 
 
610 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
622 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  36.97 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.93 
 
 
510 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
547 aa  297  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
545 aa  293  6e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
654 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  34.47 
 
 
797 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.39 
 
 
628 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
749 aa  281  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
682 aa  280  7e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
671 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  35.43 
 
 
549 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
791 aa  273  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  39.48 
 
 
519 aa  273  8.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
692 aa  272  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  32.92 
 
 
558 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  36.18 
 
 
640 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
991 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
551 aa  266  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.36 
 
 
591 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  34.98 
 
 
549 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
542 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
847 aa  257  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  35.98 
 
 
556 aa  257  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
491 aa  257  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.28 
 
 
1255 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
831 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  37.66 
 
 
1319 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  37.76 
 
 
770 aa  250  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.37 
 
 
492 aa  248  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.32 
 
 
492 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
722 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
1335 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  34.42 
 
 
489 aa  226  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
572 aa  217  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
612 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.34 
 
 
577 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.92 
 
 
544 aa  205  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.79 
 
 
552 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35 
 
 
552 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.74 
 
 
548 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  40.59 
 
 
311 aa  186  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  36.23 
 
 
473 aa  182  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  35.48 
 
 
485 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
482 aa  174  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
480 aa  173  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.8 
 
 
482 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  35.1 
 
 
485 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.74 
 
 
515 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  34.94 
 
 
440 aa  171  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  39.49 
 
 
438 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
483 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  34.59 
 
 
477 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.61 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.31 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
491 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  34.52 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  34.47 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
412 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.76 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  34.91 
 
 
433 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  38.52 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
504 aa  163  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  30.62 
 
 
498 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.81 
 
 
438 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  34.3 
 
 
508 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.91 
 
 
440 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
488 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
484 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
473 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  33.81 
 
 
446 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.93 
 
 
454 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
521 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  33.82 
 
 
447 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>